Sự nghiệp âm nhạc của James Scott trải rộng hơn bốn thập kỷ với nhiều thành tựu nổi bật trong các vai trò khác nhau như nghệ sĩ biểu diễn, nhà sư phạm và quản trị viên. Ông bắt đầu sự nghiệp của mình khi vẫn còn là sinh viên năm nhất tại Đại học Emory, sau khi chiến thắng tại cuộc thi tuyển chọn nghệ sĩ sáo và giành được vị trí trong Dàn nhạc giao hưởng Atlanta, khiến ông trở thành một trong những nghệ sĩ trẻ nhất trong lịch sử của dàn nhạc vào thời điểm đó.

Scott tốt nghiệp chuyên ngành biểu diễn sáo và piano từ Nhạc viện Oberlin và Nhạc viện Peabody, nơi ông cũng đã bảo vệ thành công luận án tiến sĩ trong lĩnh vực lý thuyết âm nhạc với đề tài liên quan đến các khía cạnh cấu trúc âm nhạc của nhà soạn nhạc Schoenberg thời kỳ tiền phi điệu tĩnh và mối quan hệ của chúng với các tác phẩm thời kỳ cuối của Brahms. Ông đã giảng dạy và giữ chức vụ lãnh đạo chương trình âm nhạc tại Đại học Rutgers trong nhiều năm. Ông cũng giữ chức Quyền Giám đốc của Trường Nghệ thuật Mason Gross trong hai năm. Trong những năm ở Rutgers, ông đã biểu diễn khắp New York, ở Canada, ở các quốc gia Đông Á, và khắp nước Mỹ. Ông cũng biểu diễn cùng với Nhóm nhạc Woodwind Repertory ở New York, Dàn nhạc Schola Cantorum, Princeton Pro Musica, Dàn nhạc Princeton Ballet, Nhà hát Opera New Jersey, Dàn nhạc Opera Metro Lyric, và Dàn nhạc thính phòng Camerata. Phần lớn sự nghiệp biểu diễn của ông được dành riêng cho việc quảng bá các tác phẩm âm nhạc hiện đại và khôi phục các tác phẩm cổ điển bị lãng quên. Với tư cách là một nghệ sỹ và quản trị viên, ông đã là thành viên Hội đồng Giám khảo trong nhiều cuộc thi và đã phục vụ cộng đồng âm nhạc New Jersey trong nhiều vai trò khác nhau, bao gồm việc là một trong những thành viên đầu tiên của hội đồng quản trị Quỹ Frank và Lydia Bergen.

Sau đó, Scott trở thành Phó Giám đốc học vụ kiêm giáo sư sáo tại Đại học Indiana, nơi ông cũng tham gia biểu diễn với tư cách bè trưởng bè sáo của dàn nhạc Festival Đại học Indiana. Ông cũng từng giữ chức vụ Giám đốc Trường Âm nhạc tại Đại học Illinois trước khi trở thành Giám đốc Trường Âm nhạc tại Đại học North Texas từ năm 2001 đến năm 2016. Giảng dạy vẫn là mối quan tâm hàng đầu của ông: nhiều cựu sinh viên của ông hiện đang đảm nhiệm các vị trí giảng dạy tại các trường đại học khác nhau. Ông tiếp tục dạy các lớp masterclass ở trong và ngoài nước. Các lớp masterclass gần đây đã được tổ chức ở Cộng hòa Séc, Đài Loan, Trung Quốc, Thái Lan, Hàn Quốc và Việt Nam.

Các chức vụ quan trọng gần đây của ông bao gồm Chủ tịch Ủy ban Kiểm định của Hiệp hội các Trường Âm nhạc Chuyên nghiệp Quốc gia Hoa Kỳ; Chủ tịch Hiệp hội Danh dự Quốc gia về Âm nhạc Pi Kappa Lambda; Chủ tịch Uỷ ban về Lãnh đạo và Quản lý Liên hiệp các Trường Âm nhạc Quốc gia; thành viên Hội đồng quản trị Dàn nhạc giao hưởng Dallas, nơi ông là Chủ tịch Chi nhánh Giáo dục; và Chủ tịch của Tổ chức Dallas Chamber Music. Ông cũng là thành viên Ban biên tập Nhà xuất bản Đại học North Texas và Tạp chí về Lãnh đạo các Trường Nghệ thuật Biểu diễn và Giáo dục Đại học. Ông thường xuyên được mời tham gia các Hội đồng thẩm định về chất lượng cho các chương trình giảng dạy âm nhạc trong nước và nước ngoài.