Nhận xét về Jean-Louis Haguenauer, Nadia Boulanger, một trong những tượng đài lớn của nền âm nhạc cổ điển thế giới đã viết rằng "sự nhạy cảm, độ chính xác, hay nói một cách súc tích: Tình Yêu, gắn liền với từng nốt nhạc, từng khoảnh khắc trong mỗi tác phẩm" ông đã đàn. Xuyên suốt sự nghiệp đầy ấn tượng của mình, Haguenauer đã biểu diễn khắp Châu Âu, Hoa Kỳ và Đông Nam Á. Ông đã xuất hiện với tư cách nghệ sĩ độc tấu trong hầu hết các sự kiện âm nhạc quan trọng ở Pháp và thường xuyên biểu diễn trên Đài Phát thanh và Truyền hình quốc gia Pháp. Haguenauer cũng tham gia vào rất nhiều các liên hoan âm nhạc mùa hè ở Châu Âu và Hoa Kỳ, bao gồm La Roque d’Anthéron, Radio-France Montpellier, Jacobins de Toulouse, Orangerie de Sceaux, les Arcs, Library of Congress Summer Chamber Festival, và Kreeger Museum June Chamber Festival.

Với tư cách là một nghệ sĩ thính phòng, Haguenauer đã cộng tác với Fine Arts Quartet, Quatuor Ébène, Percussions de Strasbourg, Ensemble Accoche-Notes, cũng như nhiều nghệ sĩ khác. Ông là thành viên sáng lập của Tam tấu Piano Galpérine-Tsan-Haguenauer và Nhóm hoà tấu TETRA bao gồm 2 Piano và bộ Gõ. Từ năm 1991 đến năm 1997, ông là thành viên của Nhóm các nghệ sĩ Thính phòng Florence Gould Hall, và từ năm 2003 đến năm 2007, ông là nghệ sĩ piano của Nhóm các nghệ sĩ Thính phòng Mỹ. Tam tấu Piano Haguenauer, với nghệ sĩ violin Austin Hartman và nghệ sĩ cello Adriana Contino, mới ra mắt vào năm 2016.

Haguenauer tốt nghiệp từ Nhạc viện École Normale de Musique ở Paris và Nhạc viện Geneva ở Thụy Sĩ, dưới sự hướng dẫn của các giáo sư chính Germaine Mounier, Louis Hiltbrand và Jean Fassina. Bên cạnh việc học piano, ông cũng theo học về sáng tác và phân tích âm nhạc với những nhà sư phạm kiệt xuất và có ảnh hưởng lớn như Nadia Boulanger và Henri Dutilleux cũng như theo học hoà tấu thính phòng với Alfred Loewenguth, thành viên sáng lập của tứ tấu đàn dây nổi tiếng Loewenguth. Haguenauer đã giành được giải thưởng của Tổ chức mang tên Yehudi Menuhin.

Haguenauer đã phát hành nhiều album solo cũng như hoà tấu. Tuyển tập album gồm 4 CD của ông, "Claude Debussy: Melodies Integrale", cộng tác với một số danh ca người Pháp xuất sắc nhất từ trước đến nay, được phát hành vào năm 2014. Đây là lần đầu tiên trong lịch sử trọn bộ các sáng tác cho thanh nhạc và piano của Debussy (hơn 100 bài hát xuyên suốt 5 tiếng đồng hồ) đã được thu âm sử dụng chính cây đàn dương cầm được làm từ năm 1904 của nhà soạn nhạc nổi tiếng này. Cuộc đời của Haguenauer là chủ đề của bộ phim La Spirale du Pianiste, một bộ phim vẫn đang được công chiếu ở Pháp.

Từ năm 1998 đến nay, Haguenauer là Giáo sư piano tại Trường Âm nhạc Jacobs trực thuộc Đại học Indiana, Bloomington (Hoa Kỳ). Trước đó ông là Giáo sư piano tại Nhạc viện Strasbourg, Pháp.